Эндосонография верхних отделов желудочно-кишечного тракта напоминает гастроскопию, нижних отделов – сигмоскопию, колоноскопию. Процедура продолжается от 20 до 60 минут. Она занимает больше времени, когда ее дополняют тонкоигольной биопсией. Обычно эндосонографию проводят в состоянии медикаментозного сна – разновидность легкого наркоза. В этом состоянии пациент во время процедуры практически ничего не чувствует, может ощущать лишь небольшой дискомфорт. В ходе эндосонографии врач следит за артериальным давлением пациента, пульсом, уровнем кислорода в крови. Примерно через час врач разрешает встать, и, если состояние пациента в порядке, отпускает домой. В этот день нельзя садиться за руль и заниматься работой, требующей концентрации внимания.